目的 探討抑癌基因Ras相關(guān)區(qū)域家族1A (RASSF1A)基因在結(jié)腸癌組織以及相應(yīng)正常結(jié)腸組織中的表達(dá)并分析其表達(dá)與結(jié)腸癌臨床病理因素之間的關(guān)系。方法 采用免疫組織化學(xué)SP法和Western blot法檢測34例結(jié)腸癌手術(shù)標(biāo)本和相應(yīng)的正常結(jié)腸組織中RASSF1A蛋白的表達(dá)水平,應(yīng)用RT-PCR法檢測RASSF1AmRNA在結(jié)腸癌和正常結(jié)腸組織中的表達(dá)情況。結(jié)果?、倜庖呓M織化學(xué)法結(jié)果:結(jié)腸癌組織中RASSF1A蛋白表達(dá)陽性率明顯低于其在正常結(jié)腸組織中的表達(dá)陽性率 〔35.3% (12/34)比97.1% (33/34),P<0.05〕。結(jié)腸癌組織中RASSF1A蛋白的表達(dá)與腫瘤分化程度和TNM分期均有關(guān)(P<0.05),即高、中分化及TNM分期較低(Ⅰ+Ⅱ期)者的RASSF1A蛋白表達(dá)陽性率較高(P<0.05)。②Western blot法結(jié)果:在34例結(jié)腸癌患者中RASSF1A蛋白表達(dá)水平明顯低于其在相應(yīng)的正常結(jié)腸組織中的表達(dá)水平 〔0.316 8±0.019 6比0.914 4±0.177 6,P<0.05〕;該結(jié)果與RT-PCR法檢測到的RASSF1A mRNA表達(dá)情況基本一致 〔0.158 9±0.223 7和0.572 3±0.193 9,P<0.05〕。結(jié)論 RASSF1A基因的失表達(dá)可能在原發(fā)性結(jié)腸癌的發(fā)生、發(fā)展中起重要作用,檢測RASSF1A的表達(dá)情況可為結(jié)腸癌的早期診斷提供幫助。
目的探討基于SHOX2和RASSF1A甲基化水平的機(jī)器學(xué)習(xí)算法預(yù)測早期肺腺癌病理類型的準(zhǔn)確性。方法回顧性分析2021年1月—2023年1月在南通大學(xué)附屬醫(yī)院接受肺部腫瘤切除手術(shù)患者的石蠟包埋(formalin-fixed paraffin-embedded,F(xiàn)FPE)標(biāo)本。根據(jù)腫瘤的病理學(xué)分類,將患者分為3組:良性腫瘤/原位腺癌(benign tumor/adenocarcinoma in situ,BT/AIS)組、微浸潤腺癌(minimally invasive adenocarcinoma,MIA)組和浸潤性腺癌(invasive adenocarcinoma,IA)組。使用LungMe試劑盒通過甲基化特異性PCR(MS-PCR)測量FFPE標(biāo)本的SHOX2和RASSF1A甲基化水平。以SHOX2和RASSF1A的甲基化水平為預(yù)測變量,采用機(jī)器學(xué)習(xí)算法(包括邏輯回歸、XGBoost、隨機(jī)森林、樸素貝葉斯)預(yù)測不同的肺腺癌病理類型,并構(gòu)建網(wǎng)絡(luò)服務(wù)器供臨床使用。 結(jié)果共納入272例患者,BT/AIS組、MIA組和IA組患者的平均年齡分別為57.97歲、61.31歲和63.84歲;女性患者占比分別為55.38%、61.11%和61.36%?;赟HOX2和RASSF1A甲基化水平建立的早期肺腺癌預(yù)測模型中,隨機(jī)森林與XGBoost模型在預(yù)測各病理類型時(shí)表現(xiàn)良好。隨機(jī)森林模型的C統(tǒng)計(jì)量在BT/AIS組、MIA組和IA組分別為0.71、0.72和0.78。XGBoost模型的C統(tǒng)計(jì)量在BT/AIS組、MIA組和IA組分別為0.70、0.75和0.77。樸素貝葉斯模型僅在IA組表現(xiàn)較為穩(wěn)健,C統(tǒng)計(jì)量為0.73,具有一定的預(yù)測能力。邏輯回歸模型在各組中的表現(xiàn)最差,對(duì)各組均無預(yù)測能力。通過決策曲線分析,隨機(jī)森林模型在BT/AIS和MIA病理類型的預(yù)測中展示了較高的凈收益,表明其在臨床應(yīng)用中具有潛在價(jià)值。結(jié)論基于SHOX2和RASSF1A甲基化水平的機(jī)器學(xué)習(xí)算法預(yù)測早期肺腺癌病理類型具有較高的準(zhǔn)確性。