引用本文: 陈鑫明, 赵平武, 何运胜, 黄坤, 黄朝林, 刘洋, 廖烽丸. 奶酪或茶摄入与胃食管反流病的因果关联:两样本孟德尔随机化研究. 中国普外基础与临床杂志, 2024, 31(9): 1099-1104. doi: 10.7507/1007-9424.202404018 复制
胃食管反流病(gastroesophageal reflux disease,GERD)是一种因胃内容物倒流至食道引起症状和(或)并发症的疾病,主要表现为胃灼热、反酸,严重者还包括吞咽困难、消化道出血、慢性咳嗽等[1]。 GERD是一种常见的消化道疾病,成人患病率为13.3% [95%CI为(12.0%,14.6%)][2],且有持续上升趋势,造成了沉重的疾病和经济负担[3]。饮食与生活方式因素被认为可影响GERD的发生[4]。奶酪是一种常见的乳制品,含有大量脂肪[5],茶则是常见的饮品,二者都是人们日常生活中较常见的两种食品。目前已有大量的研究[6–14]表明奶酪等乳制品或茶摄入对GERD发生风险的影响。上述研究大多为观察性研究及meta分析,由于观察性研究结论易受各种混杂因素的影响[15],而基于大量观察性研究的meta分析也不能消除混杂偏倚,还可因为方法学上的缺陷而引起研究结论出现更大的偏差[16]。因此,奶酪或茶摄入与GERD发生风险的因果关系仍存在争议,有必要基于可靠的因果推断方法来明确奶酪或茶摄入对GERD发生风险的因果效应。孟德尔随机化研究目前被认为是“天然的随机对照试验”[17],其主要原理是通过遗传变异在配子形成过程中随机分裂、组合的特点,对目标研究人群实行模拟随机分配[18],从而更可靠地推断出因果关系[19]。
本研究基于公开的全基因组关联研究(genome-wide association studies,GWAS)数据,使用双样本孟德尔随机化分析,探索奶酪或茶摄入与GERD发生风险的因果效应,以期为预防GERD的发生提供参考依据。
1 资料与方法
1.1 数据来源
本研究使用的所有数据来自于IEU OpenGWAS数据库。 奶酪( “ukb-b-
1.2 工具变量的筛选方法
对于奶酪或茶摄入作为暴露因素、GERD作为结局的孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)正向分析,本研究进行了严格的SNPs筛选,工具变量筛选条件如下:① SNPs与奶酪或茶摄入之间应该高度相关(显著性阈值设置为P<5×10−8);② 去除连锁不平衡导致的偏倚(R2<0.001,kb=10 000);③ 将暴露因素的SNPs与结局变量的SNPs进行汇总,同时删除不相容等位基因和中等等位基因频率的回文等位基因。经上述筛选步骤后留下的SNPs最终作为奶酪或茶摄入的工具变量用于MR正向分析。同时,本研究计算了奶酪或茶摄入的工具变量的统计量F值以评估工具变量的强弱性,以 F=10为界值,若F>10则为强工具变量,反之即为弱工具变量,将F<10的弱工具变量SNPs从分析中排除。统计量F值为工具变量中单个SNP的F值总和,单个SNP的F值计算公式如下:
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N为工具变量的有效样本量,K为工具变量的个数,R2的计算公式如下:
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MAF为SNP的次要等位基因频率,β为SNP的等位基因效应值,SE为SNP 的标准误(standard error,SE)。SE×即为标准差(standard deviation,SD)。
1.3 MR分析与敏感性分析
在双样本单向MR分析中,逆方差加权法(inverse variance weighted,IVW)被用作主要分析方法。 IVW法是使用多个SNP获得MR估计的最简单方法,IVW 法的特点是拟合时使用的权重为结局方差的倒数,回归时不考虑截距项,是两样本MR研究的标准估计方法[20],IVW法包含随机效应模型和固定效应模型。当结果存在异质性时,以IVW随机效应模型作为金标准、IVW固定效应为补充方法;当结果无异质性时,则以IVW固定效应模型为金标准、IVW随机效应模型为补充方法[21-22]。而 MR Egger和加权中位数法(weighted median,WM)则用于完善IVW结果,以提供更有力且更广泛的评估。采用Cochrane’s Q检验对结果进行异质性检验,P<0.05为存在异质性,P>0.05为不存在异质性。采用MR Egger截距法分析水平多效性。采用“留一法”逐一剔除单个 SNP 进行敏感性分析以评价结果的稳健性。通过观察漏斗图的对称性来检查可能存在的水平多效性,以衡量当前MR分析的可靠性。此外,使用β值和比值比(odds ratio,OR)及其95%可信区间(confidence interval,CI)呈现奶酪或茶摄入与GERD发生风险之间的因果关联。基于R 4.3.1软件,在 R Studio中调用“TwoSampleMR”(版本:0.5.9)包进行统计分析,并对主要分析结果进行可视化。检验水准α=0.05。研究具体流程见图1。

2 结果
2.1 奶酪摄入与GERD的因果关联分析结果
奶酪摄入与GERD因果关联分析中共纳入19个有效的SNPs(表1),其 F值范围为29.537 006 05~57.484 581 11,均为强工具变量。除 MR Egger结果无统计学意义以外,在WM、IVW随机效应模型和 IVW固定效应模型中均观察到,奶酪摄入与GERD间存在因果关联(表2和图2a)。因Cochran’s Q 检验提示结果存在异质性(P<0.001),故以 IVW随机效应模型的结果作为主要结论,即奶酪摄入对减少GERD发生风险之间可能存在正向因果关系。



a~d:奶酪摄入与GERD发生的因果关联分析的森林图(a)、散点图(b)、留一法结果(c)及漏斗图(d);e~h:茶摄入与GERD发生的因果关联分析的森林图(e)、散点图(f)、留一法结果(g)及漏斗图(h)
MR Egger回归分析结果表明,与奶酪强相关的SNP不存在水平多效性(截距为0.003,P=0.848),见图2b。留一法(图2c)和漏斗图(图2d)的结果表明,纳入的19个SNPs的因果效应估计值分布基本对称,整体不存在异质性。表明分析没有违反与IVW随机效应模型相似的因果估计。
2.2 茶摄入与GERD的因果关联分析分析结果
茶摄入与GERD因果关联分析中共纳入15个有效的SNPs(表3),其 F值范围为30.021 171 24~493.645 564 10,均为强工具变量。除MR Egger结果无统计学意义以外,在WM、IVW随机效应模型和 IVW固定效应模型中均观察到,茶摄入与GERD间存在因果关联(表2和图2e)。因Cochran’s Q检验提示结果存在异质性(P<0.001),故结果以 IVW随机效应模型的结果作为主要结论,即茶摄入对增加GERD发生风险之间可能存在正向因果关系。

MR Egger回归分析结果表明与茶叶强相关的SNP不存在水平多效性(截距为0.005,P=0.659),见图2f。留一法(图2g)和漏斗图(图2h)的结果表明,纳入的15个SNPs的因果效应估计值分布基本对称,整体不存在异质性。表明分析没有违反与IVW随机效应模型相似的因果估计。
3 讨论
本研究采用两样本MR分析方法,利用GWAS数据,分析了奶酪或茶摄入与GERD之间的因果关联。结果显示,奶酪摄入对减少GERD发生风险之间可能存在正向因果关系;茶摄入对增加GERD发生风险之间可能存在正向因果关系。
GERD是一种因胃内容物倒流至食道引起症状和(或)并发症的疾病,GERD可引起患者生活质量下降,长期治疗的需要可消耗大量卫生资源,给社会带来高昂的成本。同时老年GERD患者由于目前诊断及治疗方法的限制,具有不易痊愈的特点[23]。因此,预防GERD的发生显得至关重要。目前较多研究[6–14]表明,饮食或生活习惯与GERD发病风险有关系。 关于乳制品,Fernando等[24]的研究表明,乳制品摄入量与GERD发生率无关,但是该研究主要研究人群为代谢综合征患者,具有一定局限性,故并不能代表在正常人群中乳制品摄入量与GERD发生率的关系。更多的研究[6–9]表明,乳制品与GERD发生风险的关系目前还有争议。Ndebia等[6]、Chen等[7]的研究表明,乳制品是反酸的危险因素。另一些研究结果[8-9]却表明,乳制品对GERD发生具有保护作用。奶酪是一种常见的乳制品,本研究结果表明,奶酪摄入对减少GERD发生风险之间可能存在正向因果关系,这可能与肠道菌群失调有关[25-26]。关于茶摄入,一项印度人群的meta分析结果[10]表明,茶摄入量是GERD的危险因素。一项针对大学生的研究[11]表明,与从不喝茶的学生相比,每天喝绿茶学生更容易患GERD。Gu等[12]的研究表明,茶摄入与胃酸暴露时间及反流发作次数有关。本研究结果表明,茶摄入对增加GERD发生风险之间可能存在正向因果关系,这可能跟茶碱引起食管括约肌松弛[27]有关。
本研究也存在一定的局限性。① 所有GWAS数据均来自欧洲人群,因此限制了研究结果在其他人群中的推广性;② MR分析结果不能直接与来自临床研究的OR值进行比较,只能通过OR值判断效应方向;③ 本研究并未对奶酪具体摄入量、茶的种类等做进一步探讨,可能会致使实验结果不准确;④ 研究结论仅基于统计学结果,无法进一步探讨奶酪或茶摄入与GERD之间的生物学机制。
本研究通过两样本MR分析方法,从基因层面表明奶酪或茶摄入与GERD的发生风险存在因果关系,但仍需在更大的 GWAS数据中进行验证。在未来应关注奶酪或茶摄入与GERD发生风险相关作用靶点及机制。
重要声明
利益冲突声明:本文全体作者阅读并理解了《中国普外基础与临床杂志》的政策声明,我们没有相互竞争的利益。
作者贡献声明: 陈鑫明与赵平武共同设计研究、撰写论文初稿及最后全文校正;何运胜负责图表校正及最后全文校正;黄坤完成数据提取、整理及分析,校正图表;黄朝林参与撰写论文初稿;刘洋完成表格和图片制作;廖烽丸完成数据提取、整理。
胃食管反流病(gastroesophageal reflux disease,GERD)是一种因胃内容物倒流至食道引起症状和(或)并发症的疾病,主要表现为胃灼热、反酸,严重者还包括吞咽困难、消化道出血、慢性咳嗽等[1]。 GERD是一种常见的消化道疾病,成人患病率为13.3% [95%CI为(12.0%,14.6%)][2],且有持续上升趋势,造成了沉重的疾病和经济负担[3]。饮食与生活方式因素被认为可影响GERD的发生[4]。奶酪是一种常见的乳制品,含有大量脂肪[5],茶则是常见的饮品,二者都是人们日常生活中较常见的两种食品。目前已有大量的研究[6–14]表明奶酪等乳制品或茶摄入对GERD发生风险的影响。上述研究大多为观察性研究及meta分析,由于观察性研究结论易受各种混杂因素的影响[15],而基于大量观察性研究的meta分析也不能消除混杂偏倚,还可因为方法学上的缺陷而引起研究结论出现更大的偏差[16]。因此,奶酪或茶摄入与GERD发生风险的因果关系仍存在争议,有必要基于可靠的因果推断方法来明确奶酪或茶摄入对GERD发生风险的因果效应。孟德尔随机化研究目前被认为是“天然的随机对照试验”[17],其主要原理是通过遗传变异在配子形成过程中随机分裂、组合的特点,对目标研究人群实行模拟随机分配[18],从而更可靠地推断出因果关系[19]。
本研究基于公开的全基因组关联研究(genome-wide association studies,GWAS)数据,使用双样本孟德尔随机化分析,探索奶酪或茶摄入与GERD发生风险的因果效应,以期为预防GERD的发生提供参考依据。
1 资料与方法
1.1 数据来源
本研究使用的所有数据来自于IEU OpenGWAS数据库。 奶酪( “ukb-b-
1.2 工具变量的筛选方法
对于奶酪或茶摄入作为暴露因素、GERD作为结局的孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)正向分析,本研究进行了严格的SNPs筛选,工具变量筛选条件如下:① SNPs与奶酪或茶摄入之间应该高度相关(显著性阈值设置为P<5×10−8);② 去除连锁不平衡导致的偏倚(R2<0.001,kb=10 000);③ 将暴露因素的SNPs与结局变量的SNPs进行汇总,同时删除不相容等位基因和中等等位基因频率的回文等位基因。经上述筛选步骤后留下的SNPs最终作为奶酪或茶摄入的工具变量用于MR正向分析。同时,本研究计算了奶酪或茶摄入的工具变量的统计量F值以评估工具变量的强弱性,以 F=10为界值,若F>10则为强工具变量,反之即为弱工具变量,将F<10的弱工具变量SNPs从分析中排除。统计量F值为工具变量中单个SNP的F值总和,单个SNP的F值计算公式如下:
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N为工具变量的有效样本量,K为工具变量的个数,R2的计算公式如下:
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MAF为SNP的次要等位基因频率,β为SNP的等位基因效应值,SE为SNP 的标准误(standard error,SE)。SE×即为标准差(standard deviation,SD)。
1.3 MR分析与敏感性分析
在双样本单向MR分析中,逆方差加权法(inverse variance weighted,IVW)被用作主要分析方法。 IVW法是使用多个SNP获得MR估计的最简单方法,IVW 法的特点是拟合时使用的权重为结局方差的倒数,回归时不考虑截距项,是两样本MR研究的标准估计方法[20],IVW法包含随机效应模型和固定效应模型。当结果存在异质性时,以IVW随机效应模型作为金标准、IVW固定效应为补充方法;当结果无异质性时,则以IVW固定效应模型为金标准、IVW随机效应模型为补充方法[21-22]。而 MR Egger和加权中位数法(weighted median,WM)则用于完善IVW结果,以提供更有力且更广泛的评估。采用Cochrane’s Q检验对结果进行异质性检验,P<0.05为存在异质性,P>0.05为不存在异质性。采用MR Egger截距法分析水平多效性。采用“留一法”逐一剔除单个 SNP 进行敏感性分析以评价结果的稳健性。通过观察漏斗图的对称性来检查可能存在的水平多效性,以衡量当前MR分析的可靠性。此外,使用β值和比值比(odds ratio,OR)及其95%可信区间(confidence interval,CI)呈现奶酪或茶摄入与GERD发生风险之间的因果关联。基于R 4.3.1软件,在 R Studio中调用“TwoSampleMR”(版本:0.5.9)包进行统计分析,并对主要分析结果进行可视化。检验水准α=0.05。研究具体流程见图1。

2 结果
2.1 奶酪摄入与GERD的因果关联分析结果
奶酪摄入与GERD因果关联分析中共纳入19个有效的SNPs(表1),其 F值范围为29.537 006 05~57.484 581 11,均为强工具变量。除 MR Egger结果无统计学意义以外,在WM、IVW随机效应模型和 IVW固定效应模型中均观察到,奶酪摄入与GERD间存在因果关联(表2和图2a)。因Cochran’s Q 检验提示结果存在异质性(P<0.001),故以 IVW随机效应模型的结果作为主要结论,即奶酪摄入对减少GERD发生风险之间可能存在正向因果关系。



a~d:奶酪摄入与GERD发生的因果关联分析的森林图(a)、散点图(b)、留一法结果(c)及漏斗图(d);e~h:茶摄入与GERD发生的因果关联分析的森林图(e)、散点图(f)、留一法结果(g)及漏斗图(h)
MR Egger回归分析结果表明,与奶酪强相关的SNP不存在水平多效性(截距为0.003,P=0.848),见图2b。留一法(图2c)和漏斗图(图2d)的结果表明,纳入的19个SNPs的因果效应估计值分布基本对称,整体不存在异质性。表明分析没有违反与IVW随机效应模型相似的因果估计。
2.2 茶摄入与GERD的因果关联分析分析结果
茶摄入与GERD因果关联分析中共纳入15个有效的SNPs(表3),其 F值范围为30.021 171 24~493.645 564 10,均为强工具变量。除MR Egger结果无统计学意义以外,在WM、IVW随机效应模型和 IVW固定效应模型中均观察到,茶摄入与GERD间存在因果关联(表2和图2e)。因Cochran’s Q检验提示结果存在异质性(P<0.001),故结果以 IVW随机效应模型的结果作为主要结论,即茶摄入对增加GERD发生风险之间可能存在正向因果关系。

MR Egger回归分析结果表明与茶叶强相关的SNP不存在水平多效性(截距为0.005,P=0.659),见图2f。留一法(图2g)和漏斗图(图2h)的结果表明,纳入的15个SNPs的因果效应估计值分布基本对称,整体不存在异质性。表明分析没有违反与IVW随机效应模型相似的因果估计。
3 讨论
本研究采用两样本MR分析方法,利用GWAS数据,分析了奶酪或茶摄入与GERD之间的因果关联。结果显示,奶酪摄入对减少GERD发生风险之间可能存在正向因果关系;茶摄入对增加GERD发生风险之间可能存在正向因果关系。
GERD是一种因胃内容物倒流至食道引起症状和(或)并发症的疾病,GERD可引起患者生活质量下降,长期治疗的需要可消耗大量卫生资源,给社会带来高昂的成本。同时老年GERD患者由于目前诊断及治疗方法的限制,具有不易痊愈的特点[23]。因此,预防GERD的发生显得至关重要。目前较多研究[6–14]表明,饮食或生活习惯与GERD发病风险有关系。 关于乳制品,Fernando等[24]的研究表明,乳制品摄入量与GERD发生率无关,但是该研究主要研究人群为代谢综合征患者,具有一定局限性,故并不能代表在正常人群中乳制品摄入量与GERD发生率的关系。更多的研究[6–9]表明,乳制品与GERD发生风险的关系目前还有争议。Ndebia等[6]、Chen等[7]的研究表明,乳制品是反酸的危险因素。另一些研究结果[8-9]却表明,乳制品对GERD发生具有保护作用。奶酪是一种常见的乳制品,本研究结果表明,奶酪摄入对减少GERD发生风险之间可能存在正向因果关系,这可能与肠道菌群失调有关[25-26]。关于茶摄入,一项印度人群的meta分析结果[10]表明,茶摄入量是GERD的危险因素。一项针对大学生的研究[11]表明,与从不喝茶的学生相比,每天喝绿茶学生更容易患GERD。Gu等[12]的研究表明,茶摄入与胃酸暴露时间及反流发作次数有关。本研究结果表明,茶摄入对增加GERD发生风险之间可能存在正向因果关系,这可能跟茶碱引起食管括约肌松弛[27]有关。
本研究也存在一定的局限性。① 所有GWAS数据均来自欧洲人群,因此限制了研究结果在其他人群中的推广性;② MR分析结果不能直接与来自临床研究的OR值进行比较,只能通过OR值判断效应方向;③ 本研究并未对奶酪具体摄入量、茶的种类等做进一步探讨,可能会致使实验结果不准确;④ 研究结论仅基于统计学结果,无法进一步探讨奶酪或茶摄入与GERD之间的生物学机制。
本研究通过两样本MR分析方法,从基因层面表明奶酪或茶摄入与GERD的发生风险存在因果关系,但仍需在更大的 GWAS数据中进行验证。在未来应关注奶酪或茶摄入与GERD发生风险相关作用靶点及机制。
重要声明
利益冲突声明:本文全体作者阅读并理解了《中国普外基础与临床杂志》的政策声明,我们没有相互竞争的利益。
作者贡献声明: 陈鑫明与赵平武共同设计研究、撰写论文初稿及最后全文校正;何运胜负责图表校正及最后全文校正;黄坤完成数据提取、整理及分析,校正图表;黄朝林参与撰写论文初稿;刘洋完成表格和图片制作;廖烽丸完成数据提取、整理。