• 兰州大学第二医院 胸外科 兰州大学第二临床医学院(兰州 730030);
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目的 探讨 DDX46 基因对食管鳞癌发生发展的作用机制。方法 应用基因芯片技术检测 DDX46 基因敲减前后食管鳞癌 TE-1 细胞中全基因 mRNA 表达丰度,筛选差异表达的基因,并对其进行生物信息学分析。对表达谱筛选的其中 6 个差异基因进行实时定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)定量分析以验证结果的可靠性。结果 按照表达差异倍数之绝对值≥2,且 P<0.05 的筛选条件,筛选出差异基因 1 006 个,其中表达下调基因 644 个,表达上调基因 362 个。生物信息分析显示,差异基因主要涉及细胞周期、增殖、凋亡、黏附、能量代谢及免疫应答等生物学过程,磷脂酰肌醇-3激酶(PI3K)为重要节点分子。qRT-PCR 检测结果与基因芯片结果的验证符合率为 100%。结论 利用生物信息学方法能有效挖掘 DDX46 敲减后食管鳞癌基因芯片数据,为进一步研究 DDX46 与食管鳞癌发生发展的关系,以及寻找潜在的治疗靶点提供有价值的线索。

引用本文: 李斌, 李政, 尹泚, 蔺军平, 杨建宝, 朱多杰, 冯海明, 敬涛. 敲减 DDX46 后食管鳞癌细胞差异表达基因筛选及相互作用的生物信息学分析. 中国胸心血管外科临床杂志, 2020, 27(1): 61-67. doi: 10.7507/1007-4848.201907051 复制

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